因菲律宾射杀台湾渔船事件各方各执一词,于是双方研究决定实行“平行调查”菲律宾原则上也同意台湾派调查团赴菲调查,基于平等互惠立场,台湾也同意菲律宾派调查小组来台。菲律宾的调查小组将会有8到10名成员,等候台湾批准就会立即动身。台湾将会登上涉事之船鉴识相关枪枝以比对弹道。